Synapse kurz vor einem verheerenden globalen Angriff statt, der vom ruchlosen Colonel Peter Conrad geplant wird. Der Colonel war einst ein angesehener Anführer einer Spezialeinheit, ist dann untergetaucht und wurde zu einem berüchtigten Staatsfeind, dessen Ansichten immer gefährlicher werden und der auf der Weltbühne mit dem Armageddon droht.
Und da kommt ihr ins Spiel. Ihr spielt einen hervorragend ausgebildeten Agenten, der speziell darauf vorbereitet wurde, die Informationen zu bekommen, die zum Abwehren des Angriffs erforderlich sind. Nach der Aktivierung eines mit dem Colonel verbundenen Scanners werdet ihr in das neurosynaptische Relais transportiert, ein Zugang zum Gehirn des Colonels.
